3月上旬上海突然爆发新冠疫情，学校两校区从3月13日下午开始封控。基建处班子自3月15日起，每天上午8:30召开疫情防控视频会议，及时针对各级建管部门对建筑工地疫情防控的相关要求和学校疫情防控要求，及时指导学校两校区工地疫情防控。基建处班子成员还针对突发情况，不定时召开紧急会议商讨决策。3月26日召开全处职工视频会议，通报学校疫情防控工作情况并传达校领导、学校疫情防控专班指示精神，并压实各位员工的疫情防控责任，确保各工地疫情防控平稳有序。4月11日，基建处党支部开展疫情防控主题党日，组织每一位党员同志深入学习领会、全面贯彻落实习近平总书记关于疫情防控的重要指示精神，将思想统一到疫情防控的总方针上来。按照党中央、国务院决策部署，坚持“外防输入、内防反弹”总策略和“动态清零”总方针不动摇，坚定信心、尽锐出战，迎难而上、克难攻坚，尽快遏制疫情扩散蔓延，坚决打赢这场疫情防控的大仗硬仗。在当前这个紧要关头、关键时刻，进一步号召每一位党员为此次背水一战挺身而出、冲锋陷阵，在确保学校基本工作和疫情防控任务外，通过“先锋上海”小程序、电话等形式迅速向居住地所在居村党组织报到，给群众作表率，为社区作贡献。在大战大考中彰显特殊责任、特殊担当。
根据学校各个工地所处区域，基建处合理划分两校区工地类型，暂停部分工程，安排专人进驻工地开展疫情防控工作。基建处按照市（区）建委、属地政府及学校要求，严格落实对在建工地实施“封闭式”管理，强化主体责任落实，强化同属地社区的联动，主动纳入属地疫情防控体系，全力配合学校打赢疫情防控战。各参建单位进行防疫大检查，对照市（区）建委、属地政府及学校疫情防控要求，自查自纠，对发现问题及时整改到位，并形成书面记录；工地内进行网格化管理，做到精准防控；组织各建筑工地对从业人员进行全面核酸检测；组织各参建单位管控好各自单位人员，承担起主体责任，对滞留工人做好人文关怀；基建处指定专人负责协调物资供应保障，为工地提供基本生活和防疫物资。4月1日起，根据市（区）建管及学校要求，组织开展学校所有建筑工地预防性消毒专项行动。
为配合学校做好疫情防控工作，基建处班子和全处员工随时待命，应对解决各类突发事件。根据学校疫情防控专班指令，学校两校区校园实行网格化管理，基建处负责两校区隔离区围挡的加装任务。（1）基建处于3月25日晚接到普陀校区校园内加装围栏的指令后，迅速协调河口海岸楼自然地理楼修缮项目和水工模型实验室修缮项目的总包单位，购置了围挡材料，并安排了8名工人连夜施工，于3月27日完成了普陀校区的隔离网安装任务。（2）基建处于3月29日晚8:30接到闵行校区本科生公寓和研究生公寓加装围栏的指令。由于交通管制，相关物资购置和运输十分困难，基建处班子分头出动，全力协调各方调配各类资源。最终成功协调绿色化学大楼项目总包中建一局克服重重困难提供了运输车辆和购买了PVC围栏1800米，SPF实验动物中心项目总包上海城建市政集团提供了绿篱600米，并从校内工地派遣工人106人次负责物资搬运和安装。
疫情形势依然严峻复杂，基建处将一如既往统筹做好学校建设工程疫情防控和生产工作。
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